产品进入冷却阶段，开启水泵，把凉水输送到锅内，达到设定水位时停止，随即打开循环阀门，把锅内凉水进行循环，使产品温度均匀下降。如工作时间较长，锅内凉水降不下温时，打开溢水阀，把锅内上部热水排出，同时其它凉水进入，以达到降温目的。
锅内压力由压力变送器随着锅内压力的升降，把信号输送到压力控制仪，进行锅内压力自动条整，使锅内压力始终处于在规定的范围内。如超出，可自动停止；如下降，可自动加压保护。使锅内产品处于同等压力下进行杀菌。
在锅内达到工艺设定的冷却温度后，随即把锅内凉水排出，卸掉锅内压力，杀菌完毕，操作工人打开连锁装置，开启锅门取货。
杀菌锅分类及选择原则： 从控制方式上分有四种:1、手动控制型： 所有阀门和水泵均由手动控制，包括加水、升温、保温、降温等工序。2、电气半自动控制型： 压力由电接点压力表控制，温度由传感器（pt100）和进口温控仪控制（精度为±1℃），降温过程由人工操作。3、电脑半自动控制型: 采用PLC和文本显示器将采集的压力传感器信号和温度信号进行处理，可以储存杀菌工艺，控制精度高，温控可达±1℃。4、电脑全自动控制型 ：全部过程都有PLC和触摸屏控制，可以储存杀菌工艺，操作工只需按启动按钮即可，杀菌完毕后自动报警，温控精度可达±0.5℃。
电加热水浴杀菌锅采用转换水流方向：温度均匀、无死角杀菌锅内循环水呈上、下、左、右八个点，均匀的转换，保证了杀菌锅内从升温、杀菌、降温、冷却、锅内每个点的热分布均匀，达到了好的杀菌效果。
电加热水浴杀菌锅设备特点：
1、杀菌水经过预热，杀菌温度起点高，缩短了杀菌时间，保护了产品品质。
2、杀菌结束后的热水回收至上罐，节约蒸汽、能耗和杀菌时间。
3、针对软包装产品，特别是大块头包装，热穿透速度快，杀菌效果好。
4、PLC程序控制，杀菌实现标准化。
5、温度分布均一，产品品质轻松控制。
6、无纸记录系统（可选项）。
7、F值热分布系统（可选项）。
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